Anar al contingut (clic a Intro)
UdG Home UdG Home
Tancar
Menú

Estudia

Dades generals

Curs acadèmic:
2010
Descripció:
Avenços en l'estudi de la genètica i fisiologia dels microorganismes. Mètodes moleculars d'identificació de paràsits, fongs, bacteris i virus. Anàlisi de la diversitat microbiana en mostres complexes, mètodes de fingerprinting. Noves tècniques de cultiu.
Crèdits:
3
Idioma principal de les classes:
Català
S’utilitza oralment la llengua anglesa en l'assignatura:
Poc (25%)
S’utilitzen documents en llengua anglesa:
Completament (100%)

Grups

Grup A

Durada:
Semestral, 1r semestre
Professorat:
Luis Bañeras Vives  / Frederic Gich Batlle

Competències

  • 1. Identificar problemes, buscar solucions originals i aplicar-les en un context d'investigació o professional
  • 4. Comunicar de forma clara i concisa els seus coneixements, les seves conclusions i les implicacions ètiques i socials del seu camp de treball a públics especialitzats i no especialitzats ( divulgació científica)
  • 5. Actualitzar i prosseguir els seus estudis de forma auto-dirigida i autònoma, recollint i seleccionant la informació necessària que permeti una investigació original i que aporti nous coneixements
  • 8. integrar els aspectes metodològics i els continguts de les diferents disciplines de les biociències per al seu estudi a nivell molecular
  • 11. Identificar i analitzar els mecanismes moleculars bàsics que operen en els éssers vius, particularment l'home, així com les seves aplicacions en diferents camps d'investigació
  • 12. Gestionar i planificar l'ús racional de tècniques freqüents en Biología Molecular en noves situacions d'estudi o experimentació
  • 13. Avaluar l'ús i la necessitat de tècniques avançades en biología molecular així com la seva adaptació a necessitats particulars requerides
  • 17. Identificar i generar solucions a problemes plantejats en els àmbits de la Biomediciona Molecular i la Patologia Molecular

Altres Competències

  • Conèixer i comprendre les diferents metodologies utilitzades per l'anàlisi molecular de microorganismes i comunitats microbianes complexes.
  • Capacitat per aplicar metodologies per a la ressolució de problemes concrets

Continguts

1. BLOC 1. Mètodes moleculars per a la caracterització de microorganismes

          1.1. Noves tècniques de cultiu. Micromanipulació. Dilucions per extinció. MicroDrop. Filtres de membrana. Sistemes de diàlisi. Optimització dels medis de cultiu.

          1.2. Disseny d’encebadors i sondes moleculars específics, universals i degenerats per aplicacions de PCR i hibridació in situ. Bases de dades de seqüències i sondes per la identificació de microorganismes.

          1.3. Identificació de microorganismes mitjançant hibridació amb sondes per RNA missatger o ribosòmics in situ en mostres biològiques o sobre filtres de membrana (dot-blot). Marcatge de sondes amb isòtops i molècules fluorescents (FISH, CARD-FISH). Mètodes quimioluminiscents.

          1.4. Tècniques d’amplificació de marcadors gènics. Reacció en cadena de la polimerasa (PCR). Optimització i aplicacions. Nested-PCR, PCR quantitativa (qPCR), PCR basada en transcriptasa reversa (RT-PCR), ERIC-PCR (Enterobacterial Repetitive Intergenic Consensus PCR) i REP-PCR (Repetitive Extragenic Palindromic PCR). Multiplex- PCR, Rapid Multiplex nested PCR-ICT assay, Multiple displacement amplification (MDA). Clonació.

          1.5. Mètodes d’anàlisi de polimorfisme. Anàlisi del polimorfisme de la conformació de brins senzills SSCP (Single Strand Conformation Polymorphism). Polimorfisme de DNA amplificat a l’atzar (McRADP Melting curve of random amplified polymorphic DNA, RAPD Random amplified polymorphic DNA) per la caracterització genotípica de paràsits d’interès mèdic.

          1.6. Mètodes d’assaig immunoenzimàtics per la identificació de bacteris i paràsits d’interès sanitari.

2. BLOC 2. Mètodes moleculars per l'anàlisi de comunitats microbianes

          2.1. Mètodes d’anàlisi de la diversitat microbiana. Anàlisi de restricció de RNA ribosomal amplificat (ARDRA Amplified ribosomal RNA restriction analysis). Gels d’electroforesi d’en gradient desnaturalitzant (DGGE Denaturing gradient gel electrophoresis) i electroforesi en gradient desnaturalitzant de temperatura (TGGE Temperature gradient gel electrophoresis).

          2.2. Anàlisi de polimorfisme de longitud de fragments de restricció (RFLP, T-RFLP Terminal-Restriction Fragment Length Polymorphism). Anàlisi de similituds i comparació estadística de fingerprints.

          2.3. Anàlisi multivariant de comunitats microbianes complexes. Detecció de microorganismes indicadors.

Activitats

Tipus d’activitat Hores amb professor Hores sense professor Total
Anàlisi / estudi de casos 2,00 21,00 23,00
Lectura / comentari de textos 14,00 20,00 34,00
Sessió expositiva 9,00 0 9,00
Total 25,00 41,00 66

Bibliografia

  • Alef, Kassem (1995 ). Methods in applied soil microbiology and biochemistry . London [etc.]: Academic Press. Catàleg
  • Persing, David H. (cop. 2004 ). Molecular microbiology : diagnostic principles and practice . Washington, D.C.: ASM Press. Catàleg
  • Gerhardt, Philipp (1994 ). Methods for general and molecular bacteriology . Washington, D.C.: American Society for Microbiology. Catàleg
  • Sachse, Konrad Frey, Joachim (cop. 2003 ). PCR detection of microbial pathogens . Totowa, N.J.: Humana Press. Catàleg
  • Bartlett, John M. S. Stirling, David (cop. 2003 ). PCR protocols (2nd ed.). Totowa, N.J.: Humana Press. Catàleg

Avaluació i qualificació

Activitats d'avaluació:

Descripció de l'activitat Avaluació de l'activitat %
Comentari d'articles prèviament seleccionats sobre els continguts de l'assignatura. Resposta oral a les interpelacions realitzades pel professor durant la realització de l'activitat. Es valorarà la capacitat de comprensió, anàlisi i comunicació. 50
Presentació d'un informe sobre un cas experimental d'anàlisi de microorganismes. El treball es pot dur a terme en parelles. S'avaluarà la capacitat de comunicació (llenguatge, ortografia, presentació, comprensió) i el nivell tècnic i científic de resolució del cas plantejat aplicant els coneixements desenvolupats a l'assignatura. 50

Qualificació

La qualificació de l'assignatura es farà amb un sistema combinat que inclou dos tipus d'avaluació diferents:

A) Comentaris d'articles (50% de la nota final): Els professors posaran a disposició dels estudiants una selecció d'articles amb suficient antelació per tal que els estudiants els puguin llegir amb deteniment. La qualificació constistirà en respondre oralment a les preguntes que els professors plantejaran als estudiants durant les classes en relació al contingut de les publicacions que seran objecte de discussió.


B) Estudi de casos (50% de la nota final): Consistirà en un treball sobre un cas experimental concret de l'estudi dels microorganismes. Els estudiants hauran de fer servir els coneixements adquirits dels diferents mètodes exposats a classe per abordar un aspecte concret de l'estudi dels microorganismes. El treball es pot portar a terme en grups de dos persones com a màxim. Els professors fixaran un termini per la presentació del treball.

Criteris específics de la nota «No Presentat»:
Constarà com a No Presentat tot aquell estudiant que no s'hagi presentat a cap de les dues activitats avaluables. Per tant, la presentació a una sola de les activitats suposarà Presentat.

Observacions

Les classes de contingut teòric s'impartiran en forma de classes expositives amb suport audio-visual. Pel caràcter que es suposa a uns estudis de Tercer Cicle, les classes pretenen ser essencialment participatives i estimular la discussió dels continguts de l'assignatura. Per tant, es recomana mantenir una actitud activa i participativa.

Escull quins tipus de galetes acceptes que el web de la Universitat de Girona pugui guardar en el teu navegador.

Les imprescindibles per facilitar la vostra connexió. No hi ha opció d'inhabilitar-les, atès que són les necessàries pel funcionament del lloc web.

Permeten recordar les vostres opcions (per exemple llengua o regió des de la qual accediu), per tal de proporcionar-vos serveis avançats.

Proporcionen informació estadística i permeten millorar els serveis. Utilitzem cookies de Google Analytics que podeu desactivar instal·lant-vos aquest plugin.

Per a oferir continguts publicitaris relacionats amb els interessos de l'usuari, bé directament, bé per mitjà de tercers (“adservers”). Cal activar-les si vols veure els vídeos de Youtube incrustats en el web de la Universitat de Girona.